富特文格勒在他指挥生涯相对较晚的时候才开始在萨尔兹堡音乐节上指挥。 自从1922年他指挥的勃拉姆斯音乐会引起轰动后，富特文格勒就已经成为维也纳爱乐乐团的首席指挥之一，但是在1927年到1930年之间他仅仅指挥乐团的常规音乐会，直到1937年的夏天他才在一场维也纳爱乐乐团的音乐会上以首席指挥的身份第一次在萨尔兹堡音乐节上露面，这场音乐的主要曲目是《贝多芬第九交响曲》——他比其他的指挥家更加频繁演出这个作品。 1938年富特文革勒再次回到萨尔兹堡，但这时候德国已经吞并了奥地利，音乐节的活动变得十分不确定。原计划由他指挥的四场瓦格纳的歌剧《纽伦堡的名歌手》被取消，但他还是在8月28号指挥了一场音乐会，曲目都是他的常规曲目：菲兹纳的《Klelst`s Das Kà-thchen von Heibronn》序曲、舒伯特的《“未完成”交响曲》以及布鲁克纳的《第七号交响曲》。到1940年国家处于战争状态的时候，音乐节的音乐会活动更多的由维也纳爱乐乐团组织而非音乐节组委会，这一年的富特文格勒指挥了两场曲目相同的晚间音乐会，包括《贝多芬第八号交响曲》、《齐格弗里德的葬礼进行曲》（选自瓦格纳歌剧《众神的黄昏》）、《勃拉姆斯第一号交响曲》。1944年的音乐节因全面战争的爆发而取消，柏林方面允许在8月进行一场公众音乐会，在这场音乐会上富特文格勒指挥维也纳爱乐乐团演出了布鲁克纳的《第八号交响曲》。 在这三次萨尔斯堡演出之后是1947年到1954年之间的连续七次届萨尔兹堡音乐节。这个时候富特文格勒已经成为音乐节上举足轻重的人物。在这七次萨尔兹堡音乐节他指挥了十场音乐会，这十场音乐会的曲目都是根据同一主线制定，所选取的都是合乎指挥心意的作曲家的作品。尽管这些曲目给人的印象是莫扎特不够重视而贝多芬则被演奏得过头了，正如同富特文格勒的其他音乐会一样，贝多芬的作品在其中占有不可动摇的地位。很明显，他认为在将浪漫、后浪漫时期的作品推向全世界听众之前将它们在萨尔兹堡音乐节上演出是很重要的，尤其是那些他认为受到“刚刚经历过的德国的悲剧”影响的作品。这些作品包括舒伯特、勃拉姆斯、布鲁克纳伟大的交响乐篇章，韦伯、门德尔松、普菲兹纳的管弦乐作品，以及理查·斯特劳斯的作品——不仅仅是那四首音诗，富特文格勒在萨尔兹堡音乐节上的音乐会曲目还包括了许多20世纪作曲家的作品：斯特拉文斯基的《彼得鲁什卡》组曲、三乐章交响曲，欣德米特的《世界的和谐》交响曲、交响变形曲，甚至还有不到40岁的奥地利作曲家阿尔弗雷德·乌尔（Alfred Uhl）的管弦乐小品。 纵观富特文格勒在萨尔兹堡音乐节上的演出曲目是一件很有趣的事情，因为在这种审视过程中就能发现那个年代的演出组织者的目光就已经是不仅仅局限于传统的保守曲目，同时这种审视还提供了一个批评一些当代指挥的理由，即对20世纪的音乐作品的淡漠。富特文格勒在1949年的日记中是这样表述他的观点的“如果我对斯特拉文斯基、奥涅格、欣德米特、巴托克以及其他众多当代作曲家费尽心力写出的作品漠不关心的话，我将永远不会原谅我自己。但我也毫不隐瞒我自己对现代音乐的看法——它们的价值远远不及那些传统作品，我认为这样是正确的，也是恰当的。重点在于我从现代的音乐作品中听到了什么，它要表现什么，而不是仅仅去通读、考虑这个作品。现代音乐一旦被恰当的介绍给听众，尤其是能够真正理解作品的听众，它们也会拥有自己的生命力。”